2000年
 2000年6月26日为清华源兴的生日。清华控股有限公司、源政投资发展有限公司等股东共同确立了清华源兴“发展成为生物医药领域世界级企业”的发展目标。
 获原料药、软膏剂、片剂、胶囊剂GMP证书。
 成功上市了消化类产品“瑞倍”。
 重点投资的基因治疗药物“重组人p53腺病毒注射液”进入Ⅱ期临床。
 
 2001年
 开始开发艾滋病基因疫苗、乙肝基因治疗项目。

 2002年
 建立了由化学药/天然药中心实验室、银抗菌中心实验室和生物技术中心实验室组成的深圳研发中心。
 建立了成都研发实验室和临床研究基地。
 开始开发预防及治疗型肺癌疫苗。
 将全球第一个纳米银妇科产品阿希米（Asimi）应用于女性。
 与美国知名企业形成战略合作伙伴，共同开拓银抗菌领域的国际市场。